Cienciometría:
Implicaciones para la informática biomédica.
Abstract
Una de las características distintivas de la informática
biomédica es el uso de datos digitales tanto biomédicos como bibliográficos y
su procesamiento in silico.
Se ha convertido en uno de los rubros más novedosos para la
IB debido a las siguientes razones:
·
La gran cantidad
de artículos existentes
·
El papel
preponderante de los documentos médicos tiene, en particular, los artículos de
investigación y los casos clínicos
·
El bajo costo de
los análisis computacionales comparados con los experimentales
·
Los nuevos
formatos digitales
·
La factibilidad
de procesar cantidades inmensas de información, por la ciberinfraestructura
·
La proliferación
de repositorios en los que se publica información estandarizada.
El estudio cuantitativo de los metadatos sobre la
bibliografía especializada se denomina Cienciometría (si se pone énfasis en que
es el protocolo principal de la ciencia) o bibliometría (si el énfasis se pone
en que son documentos).
Los detalles sobre el método bibliométrico puede consultarse
en Biomedical Engineering – From Theory to Applications. En general este método
consta del análisis cuantitativo de los metadatos bibliográficos de los
documentos. El propósito de estos estudios puede clasificarse en seis
categorías:
a) Recuperación de información médica
b) Obtención de nuevo conocimiento médico
c) Revisiones bibliográficas y estados de arte sobre medicina
d) Análisis de las ciencias médicas
e) Evaluación, gestión y política científica para medicina
f) Generación y normalización de otras colecciones
bibliográficas
Desarrollo
Existen diferentes tipos de metodología biomédica vinculados
de manera directa con la bibliografía, cada una de estas identidades puede
correlacionarse con otras a partir del uso de identificaodores únicos como el
PubMed o DOI para bibliografía, el GeneBank para genes o el de UniProt para
proteínas.
Entre todos los tipos de documentos biomédicos los más
utilizados son ocho:
1. Informe de casos
2. Articulo clásico
3. Ensayo clínico
4. Estudio comparativo
5. Ensayo clínico controlado
6. Casos legales
7. Meta-análisis
8. Revisión
La recuperación
de la información
Se refiere a la búsqueda y recuperación de la información;
su función es recuperar bibliografía exhaustiva de un tema en específico, para
analizarla y difundirla, con el fin de resolver un problema médico determinado.
Es necesario tener una pregunta o problema claro al cual se
enfocará la investigación. Va de lo general a lo particular y consiste en
obtener la mayor cantidad de información disponible. Deben seguirse las
siguientes estrategias:
ü
Establecer
claramente la pregunta
ü
Identificar los
términos de búsqueda
ü
Diseñar las
consultas con los términos elegidos
ü
Definir los
campos de búsqueda de la colección
ü
Refinar la
consulta tantas veces como sea necesario hasta encontrar resultados completos y
exactos
ü
Producir
definiciones operativas que permitan tomar decisiones
ü
Llevar a cabo el
proceso de búsqueda selección y evaluación
ü
Sistematizar los
registros seleccionados, depurarlos y curarlos.
El análisis de la
bibliografía
Se refiere a documentos que utilizan la bibliometría para
presentar estados del arte o incluso obtener tendencias de investigación,
entender las características de un conjunto de bibliografía y reconocer las
revistas y los autores que más publican.
Se usan principalmente los datos bibliográficos, como
autores, revistas, palabras clave, año de publicación, descriptores, citas
bibliográficas, institución de adscripción del autor, país de adscripción y
resumen, en la medicina basada en evidencia a partir de los ensayos clínicos.
También existen aplicaciones Web que nos permiten recuperar
información y analizar tendencias de la bibliografía en el área biomédica en
tiempo real, muchas de las cuales utilizan la bibliografía de PubMed.
La obtención de
nuevo conocimiento
Es el proceso más complejo y ambicioso del análisis
bibliométrico, generado a partir del procesamiento de grandes cantidades de
bibliografía biomédica especializada. Descubrimiento basado en bibliografía se
refiere al uso de artículos de investigación y fue desarrollada por Don R.
Swanson en la década de 1980.
El procedimiento incluye además de la bibliometría, la
implementación de métodos de vanguardia como la minería de textos.
El proceso abarca un gran número de pasos que dependen del
tipo de información y los resultaos. Es fundamental para el campo de la
medicina basada en evidencia.
Es un método eficiente y útil para lograr conclusiones más
precisas.
En 2012 clasificaron y marcaron diferentes componentes de
los artículos biomédicos como proteínas, genes, nombres de fármacos, modelos
biológicos y diagnósticos médicos, mediante el significado de las palabras
(semántica).
En 2013 Hristovski recalcó la importancia del descubrimiento
basado en la bibliografía analizando artículos indexados en Medline con una
hipótesis en mente: ligar tres conceptos que no estaban ligados por si mismos:
1. Enfermedades
2. Patologías/función celular
3. Drogas y genes
Con base en el significado de la palabra (ontología).
Conclusiones
En Cienciometría el análisis se hace cuantitativo de los
metadatos de la bibliografía.
Las principales aplicaciones de la Cienciometría en la
información biomédica son la recuperación de información, el análisis de la
bibliografía y la obtención de nuevo conocimiento biomédico.
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